Los endocrinólogos diagnostican y tratan el desequilibrio hormonal que causa la infertilidad, y también evalúan y tratan a pacientes con problemas reproductivos. Trabajan con pacientes que necesitan reemplazamiento hormonal. Los problemas que tratan incluyen los síntomas de la menopausia, menstruación irregular, endometriosis, síndrome de ovario poliquístico, síndrome premenstrual e impotencia.

Los endocrinólogos tratan a pacientes que sufren de sobrepeso u obesidad, con frecuencia por causa de problemas metabólicos y hormonales. Las enfermedades de la tiroides, las suprarrenales, los ovarios y la pituitaria pueden causar obesidad. Los endocrinólogos también identifican factores asociados a la obesidad tales como resistencia a la insulina y problemas genéticos. Los trastornos lípidos pueden encontrarse en varias enfermedades que necesitan tratarse de manera especial, incluso el síndrome metabólico, el síndrome de ovario poliquístico y la obesidad. Es posible que receten dietas especiales, ejercicios y medicamentos para manejar la hiperlipidemia y otros trastornos lípidos.

Osteomalacia (raquitis, que ablanda los huesos) y la osteoporosis son enfermedades de los huesos que son diagnosticadas y tratadas por los endocrinólogos. La osteoporosis es una enfermedad que debilita el esqueleto. Ciertas hormonas actúan para proteger el tejido óseo. Cuando bajan los niveles hormonales, los huesos pueden perder calcio y debilitarse. La menopausia, en las mujeres, y la pérdida de la función testicular, en los hombres, y la edad pueden poner a la gente a riesgo de fracturarse los huesos. Los endocrinólogos tratan otras enfermedades que pueden afectar los huesos, tales como un exceso de la hormona paratiroidea, y el uso a largo plazo de esteroides como la prednisona (la cual se usa como tratamiento para otras condiciones).